MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Lactococcus lactis subsp. lactis KF147 plasmid pKF147A

Total Repeats: 480

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_013657	TGA	2	6	602	607	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	281427969
2	NC_013657	TGC	2	6	689	694	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	281427969
3	NC_013657	GA	3	6	731	736	50 %	0 %	50 %	0 %	281427969
4	NC_013657	A	6	6	853	858	100 %	0 %	0 %	0 %	281427969
5	NC_013657	ATG	3	9	919	927	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	281427969
6	NC_013657	AATA	2	8	950	957	75 %	25 %	0 %	0 %	281427969
7	NC_013657	A	6	6	987	992	100 %	0 %	0 %	0 %	281427969
8	NC_013657	TGAT	2	8	1057	1064	25 %	50 %	25 %	0 %	281427969
9	NC_013657	CAA	2	6	1142	1147	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	281427969
10	NC_013657	TGA	2	6	1232	1237	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	281427969
11	NC_013657	A	7	7	1245	1251	100 %	0 %	0 %	0 %	281427969
12	NC_013657	A	6	6	1313	1318	100 %	0 %	0 %	0 %	281427969
13	NC_013657	A	6	6	1323	1328	100 %	0 %	0 %	0 %	281427969
14	NC_013657	ACT	2	6	1365	1370	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	281427969
15	NC_013657	GAA	2	6	1426	1431	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	281427969
16	NC_013657	GCA	2	6	1480	1485	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	281427969
17	NC_013657	AT	3	6	1489	1494	50 %	50 %	0 %	0 %	281427969
18	NC_013657	CTT	2	6	1510	1515	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	281427969
19	NC_013657	AAT	2	6	1613	1618	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	281427969
20	NC_013657	ATT	2	6	1633	1638	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	281427969
21	NC_013657	GAT	2	6	1659	1664	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	281427969
22	NC_013657	CTT	2	6	1671	1676	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	281427969
23	NC_013657	GTG	2	6	1702	1707	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	281427969
24	NC_013657	TAA	2	6	1781	1786	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	281427969
25	NC_013657	GTT	2	6	1800	1805	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	281427969
26	NC_013657	AAAT	2	8	1811	1818	75 %	25 %	0 %	0 %	281427969
27	NC_013657	AAC	2	6	1841	1846	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	281427969
28	NC_013657	AATG	2	8	1907	1914	50 %	25 %	25 %	0 %	281427969
29	NC_013657	TAAA	2	8	1928	1935	75 %	25 %	0 %	0 %	281427969
30	NC_013657	ACA	3	9	2736	2744	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	281427970
31	NC_013657	TTGA	2	8	2793	2800	25 %	50 %	25 %	0 %	281427970
32	NC_013657	TGA	2	6	2888	2893	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	281427970
33	NC_013657	ATTC	2	8	2995	3002	25 %	50 %	0 %	25 %	281427970
34	NC_013657	TCA	2	6	3012	3017	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	281427970
35	NC_013657	A	7	7	3026	3032	100 %	0 %	0 %	0 %	281427970
36	NC_013657	ATT	2	6	3061	3066	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	281427970
37	NC_013657	TAT	2	6	3068	3073	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	281427970
38	NC_013657	CAA	2	6	3085	3090	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	281427970
39	NC_013657	ATT	3	9	3111	3119	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	281427970
40	NC_013657	TGA	2	6	3125	3130	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	281427970
41	NC_013657	ATC	2	6	3135	3140	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	281427970
42	NC_013657	ATCA	2	8	3195	3202	50 %	25 %	0 %	25 %	281427970
43	NC_013657	ATT	2	6	3204	3209	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	281427970
44	NC_013657	GAT	2	6	3210	3215	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	281427970
45	NC_013657	ATA	2	6	3265	3270	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	281427970
46	NC_013657	ACA	2	6	3315	3320	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	281427970
47	NC_013657	GAT	2	6	3405	3410	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	281427970
48	NC_013657	TGA	2	6	3425	3430	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	281427970
49	NC_013657	A	6	6	3448	3453	100 %	0 %	0 %	0 %	281427970
50	NC_013657	A	8	8	3506	3513	100 %	0 %	0 %	0 %	281427971
51	NC_013657	A	6	6	3521	3526	100 %	0 %	0 %	0 %	281427971
52	NC_013657	GAG	2	6	3537	3542	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	281427971
53	NC_013657	AAC	2	6	3561	3566	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	281427971
54	NC_013657	TTA	2	6	3618	3623	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	281427971
55	NC_013657	AAC	2	6	3640	3645	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	281427971
56	NC_013657	ATTG	2	8	3665	3672	25 %	50 %	25 %	0 %	281427971
57	NC_013657	A	6	6	3699	3704	100 %	0 %	0 %	0 %	281427971
58	NC_013657	TGA	2	6	3758	3763	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	281427971
59	NC_013657	GACGAG	2	12	3765	3776	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	281427971
60	NC_013657	CTCG	2	8	3817	3824	0 %	25 %	25 %	50 %	281427971
61	NC_013657	AGA	3	9	3839	3847	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	281427971
62	NC_013657	A	6	6	3847	3852	100 %	0 %	0 %	0 %	281427971
63	NC_013657	CAT	2	6	3857	3862	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	281427971
64	NC_013657	TGA	2	6	3863	3868	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	281427971
65	NC_013657	A	6	6	3894	3899	100 %	0 %	0 %	0 %	281427971
66	NC_013657	GAA	2	6	4023	4028	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	281427971
67	NC_013657	GAA	3	9	4131	4139	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	281427971
68	NC_013657	A	6	6	4152	4157	100 %	0 %	0 %	0 %	281427971
69	NC_013657	TTGA	2	8	4158	4165	25 %	50 %	25 %	0 %	281427971
70	NC_013657	GTT	2	6	4166	4171	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	281427971
71	NC_013657	TTTA	2	8	4206	4213	25 %	75 %	0 %	0 %	281427972
72	NC_013657	ATT	2	6	4280	4285	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	281427972
73	NC_013657	ATTT	2	8	4321	4328	25 %	75 %	0 %	0 %	281427972
74	NC_013657	T	6	6	4326	4331	0 %	100 %	0 %	0 %	281427972
75	NC_013657	GAT	2	6	4396	4401	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	281427972
76	NC_013657	T	8	8	4430	4437	0 %	100 %	0 %	0 %	281427972
77	NC_013657	TCA	2	6	4495	4500	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	281427972
78	NC_013657	TCC	2	6	4567	4572	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	281427973
79	NC_013657	CT	3	6	4573	4578	0 %	50 %	0 %	50 %	281427973
80	NC_013657	TGC	2	6	4584	4589	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	281427973
81	NC_013657	ACT	2	6	4641	4646	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	281427973
82	NC_013657	TCA	2	6	4687	4692	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	281427973
83	NC_013657	T	6	6	4716	4721	0 %	100 %	0 %	0 %	281427973
84	NC_013657	TTC	2	6	4734	4739	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	281427973
85	NC_013657	AAAG	2	8	4753	4760	75 %	0 %	25 %	0 %	281427973
86	NC_013657	AG	3	6	4779	4784	50 %	0 %	50 %	0 %	281427973
87	NC_013657	C	6	6	4819	4824	0 %	0 %	0 %	100 %	281427973
88	NC_013657	AGA	2	6	4911	4916	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	281427973
89	NC_013657	AGC	2	6	4932	4937	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	281427973
90	NC_013657	TTGC	2	8	4957	4964	0 %	50 %	25 %	25 %	281427973
91	NC_013657	TTG	2	6	5081	5086	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	281427973
92	NC_013657	TC	3	6	5104	5109	0 %	50 %	0 %	50 %	281427973
93	NC_013657	TCG	2	6	5119	5124	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	281427973
94	NC_013657	A	6	6	5140	5145	100 %	0 %	0 %	0 %	281427973
95	NC_013657	GTTT	2	8	5228	5235	0 %	75 %	25 %	0 %	281427973
96	NC_013657	TTA	2	6	5299	5304	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	281427973
97	NC_013657	GCAA	2	8	5377	5384	50 %	0 %	25 %	25 %	281427973
98	NC_013657	TCCCA	2	10	5394	5403	20 %	20 %	0 %	60 %	281427973
99	NC_013657	AGA	2	6	5498	5503	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	281427973
100	NC_013657	A	6	6	5527	5532	100 %	0 %	0 %	0 %	281427973
101	NC_013657	TCA	2	6	5536	5541	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	281427973
102	NC_013657	TCA	2	6	5560	5565	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	281427973
103	NC_013657	GGA	2	6	5632	5637	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	281427973
104	NC_013657	T	6	6	5814	5819	0 %	100 %	0 %	0 %	281427973
105	NC_013657	AGT	2	6	5886	5891	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	281427973
106	NC_013657	ACG	2	6	5964	5969	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	281427973
107	NC_013657	AGT	2	6	5981	5986	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	281427973
108	NC_013657	TTTAAT	2	12	5998	6009	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	281427973
109	NC_013657	GGA	2	6	7403	7408	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	281427974
110	NC_013657	CA	3	6	7431	7436	50 %	0 %	0 %	50 %	281427974
111	NC_013657	A	6	6	7586	7591	100 %	0 %	0 %	0 %	281427974
112	NC_013657	TTATT	2	10	7629	7638	20 %	80 %	0 %	0 %	281427974
113	NC_013657	ATT	2	6	7677	7682	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	281427974
114	NC_013657	A	8	8	7725	7732	100 %	0 %	0 %	0 %	281427974
115	NC_013657	GA	3	6	7810	7815	50 %	0 %	50 %	0 %	281427974
116	NC_013657	ATT	2	6	7828	7833	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	281427974
117	NC_013657	A	6	6	7907	7912	100 %	0 %	0 %	0 %	281427974
118	NC_013657	AAAAAT	2	12	7915	7926	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	281427974
119	NC_013657	AT	3	6	7925	7930	50 %	50 %	0 %	0 %	281427974
120	NC_013657	TTTAT	2	10	8346	8355	20 %	80 %	0 %	0 %	281427975
121	NC_013657	GAAT	2	8	8372	8379	50 %	25 %	25 %	0 %	281427975
122	NC_013657	AAAT	2	8	8381	8388	75 %	25 %	0 %	0 %	281427975
123	NC_013657	ATA	2	6	8416	8421	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	281427975
124	NC_013657	TAT	2	6	8463	8468	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	281427975
125	NC_013657	TTG	2	6	8513	8518	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	281427975
126	NC_013657	GA	3	6	8519	8524	50 %	0 %	50 %	0 %	281427975
127	NC_013657	A	6	6	8544	8549	100 %	0 %	0 %	0 %	281427975
128	NC_013657	TAT	2	6	8589	8594	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	281427975
129	NC_013657	ATTA	2	8	8622	8629	50 %	50 %	0 %	0 %	281427975
130	NC_013657	TGA	2	6	8632	8637	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	281427975
131	NC_013657	TTA	2	6	8647	8652	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	281427975
132	NC_013657	TA	3	6	8798	8803	50 %	50 %	0 %	0 %	281427976
133	NC_013657	A	6	6	8825	8830	100 %	0 %	0 %	0 %	281427976
134	NC_013657	TAC	2	6	8831	8836	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	281427976
135	NC_013657	ATA	2	6	8875	8880	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	281427976
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137	NC_013657	A	6	6	8910	8915	100 %	0 %	0 %	0 %	281427976
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